본 발명은 신규한 내열성 갈락토스 이성화효소 및 그를 이용한 타가토스 제조방법에 관한 것으로, 자연계 유전자원으로부터 내열성 및 반응평형이 증대된 갈락토스 이성화효소 유전자를 스크리닝하고, 이를 포함한 발현벡터로 형질전환시킨 미생물을 배양하여 갈락토스 이성화효소를 제조한 후, 상기 제조된 효소를 이용하여 갈락토스로부터 타가토스를 제조한 결과, 상기 이성화효소는 55℃의 고온에서 46-50%의 높은 전환수율로 타가토스를 생성하는 매우 뛰어난 효과가 있었다.