한국의 고문헌은 대부분 한자를 사용하여 기록되었으며, 이러한 한자들은 본자(本字)와 뜻은 같지만 모양이 틀린 이체자(異體字)와 오자(誤字)나 탈자(脫字)로써 간주되는 파자(破字) 등을 포함하므로 고문헌의 입력이나 저장 관점에서 여러 가지 문제점을 갖는다. 이러한 한국 고문헌의 효과적인 입력과 저장을 위해 본 연구에서는 유니코드(Unicode)를 사용하였으며, 고문헌의 문서 구조 표현을 위해 SGML을 사용하였다. 유니코드로 입력된 고문헌을 저장하기 위해서는 여러 변환 작업을 수행해야 하며, 문서 내에 삽입된 SGML 태그(tag)들을 분석하고 문헌 검색을 위한 각종 색인을 생성하기 위해 유니코드 문서의 전처리를 필요로 한다. 본 논문은 유니코드 문서의 효율적인 저장 방법을 제시하고 한국 고문헌을 위한 전처리와 SGML 문서 구조 분석 및 저장 방법과 색인 생성 방법에 대해 기술한다. 본 연구는 자체 개발된 유니코드를 사용하는 SGML 문서 편집기를 통하여 입력된 한국 불교 전서를 대상으로 하였으며, 윈도우 NT(4.0버전)에서 운영되는 마이크로소프트사의 SQL Server(6.5버전)를 데이터베이스 관리 시스템으로 사용하여 구현하였다.