هدف از این تحقیق، جداسازی و شناسایی مولکولی باکتری‌های همراه با اسفنج با پتانسیل تجزیه زیستی نفت خام می باشد. بافت مزوهیل اسفنج Pachychalina sp. هموژنیزه شده و رقت های مختلف آن در محیط کشت های مناسب کشت داده شد. کلنی های به دست آمده بر اساس شاخص امولسیون سازی و میزان رشد در محیط حاوی 2% نفت غربالگری شدند. از بین باکتری های جداسازی شده، 6 باکتری بالاترین میزان رشد در محیط نفتی را دارا بودند که میزان حذف نفت توسط 6 سویه مذکور در محیط نمکی حداقل مورد سنجش قرار گرفت. سویه ها همچنین بر اساس توالی ژن SrRNA 16 و با انجام PCR مورد شناسایی مولکولی قرار گرفتند. نتایج حاصل از بررسی درصد حذف نفت بر اساس دو روش جذب در 420 نانومتر و میزان وزن خشک تایید کننده یکدیگر بوده و هر دو از یک الگو پیروی نمودند. بر این اساس، سویه های KE5 و KE8 بیشترین میزان حذف نفت را نشان دادند که نتایج شناسایی مولکولی این دو سویه مشخص نمود بیشترین شباهت را به ترتیب با سویه های Staphylococcus aureus subsp.N315 و Luteimonas terricola BZ92r دارا می باشند. با توجه به نتایج به دست آمده از همترازی های ژنومی، تعیین فاصله ژنتیکی و رسم درخت فیلوژنتیکی، به نظر می رسد سویه های KE6 و KE7 به ترتیب با داشتن 86% و 90% شباهت با سویه های Exiguobacterium sp. AT1b و Pseudomonas rhodesiae CIP 104664 پتانسیل قابل توجهی برای انجام مطالعات بیشتر مولکولی و بیوشیمیایی دارا بودند.