. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . ii Acknowledgments . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . iv List of Abbreviations . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . ix CHAPTER 1 Literature Review 1.1 Biology of Chlamydiae . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 1 1.2 Taxonomy of Chlamydiae . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 4 1.3 Importance of Chlamydia spp. . . .. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 10 1.4 Genetic-, Bioand Sero-variants of Chlamydia spp. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 12 1.5 Need for Specific Serological Assays . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 16 1.6 Problems with Current Serological Assays . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 18 1.7 Research Rationale and Objectives . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 22 REFERENCES . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 23 CHAPTER 2 Chlamydia species-specific Serological Assays 2.